คุณอลงกรณ์มีแนวคิดและนโยบายที่จะให้ระบบการศึกษาไทยมีประสิทธิภาพมากที่สุด ระบบมหาวิทยาลัยที่เฉพาะเจาะจงเช่น มหาวิทยาลัยการแพทย์ มหาวิทยาลัยภาษา   มหาวิทยาลัยโรงแรม เป็นต้น
ระบบการศึกษาที่รัฐบาลทุ่มงบมากที่สุดกระทรวงศึกษาธิการ แต่กลับพัฒนาได้นิดเดียว