I am sure you have everything under control.

ในความหมายตรงๆ คือเค้าจะบอกว่า เค้ามั่นใจว่าผมจะควบคุมงานที่มีอยู่ได้ทั้งหมดใช่ไหมครับ คือหมายถึง "เอาอยู่" ทำนองนั้น
หรือพยายามจะบอกว่า คุณมีงานเยอะ ทุกสิ่งทุกอย่างคุณต้องควบคุมมัน

บริบท คือว่า ผมreport ไปที่ เจ้านาย เป็น Native speaker ว่าในทีมมีคนลาเยอะในสัปดาห์นี้ และไม่มีคนทดแทน ต้องทำงานภายใต้กำลังคนที่จำกัด

ขอบคุณครับ