จากกรณีมีผู้ร้องเรียนคุณภาพอาหารของร้าน Subway เช่น สีเลอะติดอาหาร ขนมปังไม่ใช่ของ Subway และมีการออกมาชี้แจ้งว่า สาขากว่า 100 สาขา เป็นร้านที่ถูกบอกยกเลิกแฟรนไชส์ไปแล้ว เหลือเพียง 51 สาขาที่ยังคงเป็นแฟรนไชส์ของ Subway ล่าสุด ทางบริษัทได้แจ้งว่า 
ในส่วนของร้านค้าแฟรนไชส์ที่ถูกยกเลิกสิทธิ์แฟรนไชส์ และยังคงฝ่าฝืนดำเนินการเปิดร้านอยู่ นั้นทางบริษัทกำลังเร่งดำเนินการตามกระบวนการทางกฎหมาย
ทั้งนี้ ทาง Subway ยังแนะวิธีสังเกตหน้าร้านแฟรนไชส์ที่ถูกต้อง โดย จะต้องมีเลขที่ร้านและเครื่องหมายสัญลักษณ์ Authorized Franchise จะเป็นแฟรนไชส์ที่ได้รับสิทธิโดยถูกต้องพร้อมบริการตามปกติ มีอาหาร และวัตถุดิบครบทุกเมนู รวมทั้ง อโวคาโด , มะกอก และ อื่นๆ ถูกต้องตามมาตรฐานของ Subway 
อย่างไรก็ตาม ร้านที่ถูกยกเลิกสิทธิ์แฟรนไชส์ มีจำนวนมากกว่า 100 สาขา ขณะที่ร้านที่ยังคงเป็นแฟรนไชส์ของ Subway มีอยู่ 51 สาขาเท่านั้น