การแปรงฟันยังคงเป็นวิธีหลักในการทำความสะอาดช่องปาก แต่บริเวณซอกฟันจะเป็นบริเวณที่ขนแปรงสีฟันไม่สามารถเข้าไปทำความสะอาดได้อย่างทั่วถึง มักเกิดฟันผุและเหงือกอักเสบได้ง่ายกว่าบริเวณอื่น

ดังนั้นการแปรงฟันเพียงอย่างเดียวจะไม่สามารถทำความสะอาดซอกฟันได้หมดจด จำเป็นต้องใช้ไหมขัดฟันร่วมด้วยอย่างน้อยวันละ 1 ครั้ง
เพื่อกำจัดคราบอาหารและเชื้อจุลินทรีย์ที่อยู่บริเวณซอกฟัน ลดความเสี่ยงการเกิดฟันผุบริเวณซอกฟัน และลดความเสี่ยงการเกิดโรคเหงือกอักเสบ

การใช้ไหมขัดฟันสามารถปฏิบัติได้ไม่ยาก ดังต่อไปนี้

1. ดึงไหมขัดฟันความยาวประมาณ 45 เซนติเมตร พันที่บริเวณปลายนิ้วกลางทั้ง 2 ข้าง โดยเหลือความยาวของไหมขัดฟันที่พันระหว่างนิ้วประมาณ 2-3 เซนติเมตร
2. สอดไหมขัดฟันเข้าที่ซอกฟันและเหงือก โดยใช้นิ้วโป้งและนิ้วชี้ ในการควบคุมไหม โอบไหมขัดฟันรอบตัวฟัน จากนั้นทำการขัดหรือถูในทิศทางขึ้นลง หรือโค้งเป็นรูปตัว C ควรทำด้วยความระมัดระวังเพราะอาจทำให้เลือดออกได้หากใช้ไหมขัดฟันลึกลงไปในเหงือกมากเกินไป
3. ควรใช้ไหมขัดฟันให้ครบทุกซี่ รวมถึงซอกด้านหลังของฟันซี่สุดท้าย เมื่อขัดฟันครบทุกซี่แล้วควรบ้วนปากเพื่อขจัดคราบแบคทีเรียบนผิวฟันและเศษอาหารที่ยังคงหลงเหลืออยู่
4. ควรทิ้งไหมขัดฟันหลังการใช้งาน ไม่ควรนำกลับมาใช้ซ้ำ เพราะประสิทธิภาพของไหมขัดฟันจะลดลง และอาจมีเชื้อแบคทีเรียตกค้างจากการใช้งานครั้งที่ผ่านมา