เจอคำตอบแล้วครับ มาอัพเดทไว้ในนี้ด้วยเผื่อใครที่เจอปัญหาเหมือนกัน เนื่องจากผม google เต็มที่ด้วยความรู้เรื่อง video อันน้อยนิดแล้วยังไงก็ไม่เจอซักที หวังว่าการค้นพบครั้งนี้จะเป็นประโยชน์ครับ

ปัญหาเกิดจาก IINA ใช้ Engine mpv ในการทำงาน (ซึ่งคนที่ใช้ mpv ตรง ๆ เลยก็น่าจะเจอปัญหาซับโดนยืดแบบนี้เหมือนกัน)
ซึ่ง mpv ตัวนี้มันดันเปิด option --sub-ass-vsfilter-aspect-compat=yes โดย default

https://mpv.io/manual/master/#options-sub-ass-vsfilter-aspect-compat

ซึ่งพอเปลี่ยนเป็น no ปั๊บ กลับมาปกติทันทีเลย