ต่างกันครับ
ความละเอียด (มิใช่ความละเอียดของกล้อง หรือภาพ นะครับ  แต่เป็นความละเอียดคมชัดของงาน)
โฟกัส

คือ การ Scan นั้น สิ่งรบกวนน้อยครับ
เพราะเอกสารแนบกับถาดสแกนเลย (ยกเว้น คุณพบปัญหาอื่นใด ในการวางต้นฉบับไม่นิ่ง ไม่แนบ ซึ่งอันนี้ไม่เกี่ยวกับ คุณสมบัติ แต่เกี่ยวกับวิธีการใช้งาน)

ในขณะที่การใช้กล้องดิจิตอลถ่ายนั้น
มีทั้งแสงภายนอก ทั้งความสั่นไหวของมือ ทั้งลมที่พัดโดนกระดาษ (กรณีไม่มีอะไรมายึดไว้)
แล้วยังเรื่องของการโฟกัส หน้ากระดาษอีก ครับ