เชื้อโรคในช่องปาก มีหลายชนิด
บางชนิดทำให้ฟันผุ บางชนิดทำให้เป็นโรคเหงือก บางชนิดไม่ก่อโรค

วิธีควบคุมเชื้อโรคที่ดีที่สุดคือการกำจัดอาหารไม่ให้อยู่ในช่องปาก (แปรงฟัน +ใช้ไหมขัดฟัน)
เชื้อโรคจะได้ไม่เจริญเติมโตมาก จนเกิดโรค  

บางคนที่ไม่สามารถทำความสะอาดได้ดี หรือเป็นโรคเหงือก มีร่องลึกปริทันต์ ก็สามารถใช้ น้ำยาบ้วนปาก
หรือ น้ำเกลือ บ้วนเพื่อลดเชื้อโรคในช่องปากได้

น้ำเกลือ ถ้ารักษาความเค็มในช่องปากได้ เชื้อโรคก็จะไม่เติบโต (เหมือนการถนอมอาหาร พวกไข่เค็ม ปลาเค็ม อาหารไม่เน่า)
แต่สุดท้ายถ้ากลืนเกลือลงไปเยอะๆ ก็ทำให้เกิดโรคไต โรคความดัน ได้

พวกน้ำยาบ้วนปาก มีฤทธิ์ ฆ่าเชื้อโรคในปากได้  ถ้าใช้ในปริมาณเหมาะสมจะดี  
แต่ถ้าใช้มากเกินไปจะเกิดเชื้อราในช่องปากขึ้นมาแทน