ตลอดขั้นตอนการเก็บรวบรวมผลคะแนน ควบคุมการดำเนินการ และการตรวจนับคะแนน ดำเนินการโดย คณะทำงานวิจัยรวบรวมผลคะแนนการตัดสินรางวัลนาฏราช ครั้งที่ 16 ประกอบด้วย หน่วยงานกลางควบคุม ได้แก่ ผู้แทน 4 สถาบันการศึกษา (1) คณะนิเทศศาสตร์และนวัตกรรมการจัดการ สถาบันบัณฑิตพัฒนบริหารศาสตร์ (2) คณะวารสารศาสตร์ มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ (3) คณะนิเทศศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย และ (4) คณะนิเทศศาสตร์ มหาวิทยาลัยอัสสัมชัญ ร่วมกับศูนย์บริการวิชาการนิด้า โดยมีหน่วยงานรวบรวมผลคะแนน ทำหน้าที่รวบรวมผลคะแนนจากผู้มีสิทธิลงคะแนน ได้แก่ ศูนย์สำรวจความคิดเห็น “นิด้าโพล” (NIDA Poll) ทั้งนี้ รายชื่อผลงานที่ผ่านเข้ารอบตัดสิน รางวัลนาฏราช ครั้งที่ 16 ประจำปี 2567 นี้ มาจากการร่วมลงคะแนนของผู้มีสิทธิลงคะแนนในรอบคัดเลือก ซึ่งดำเนินการ เก็บรวบรวมคะแนนระหว่างวันที่ 13 - 24 กุมภาพันธ์ 2568 รวม 52 รางวัล

ทั้งนี้ สำหรับขั้นตอนต่อไปเป็นการลงคะแนนในรอบตัดสิน ผู้มิสิทธิลงคะแนนจะดำเนินการ ลงคะแนนระหว่างวันที่ 10 มีนาคม – 30 เมษายน 2568 โดยหน่วยงานกลาง ประกอบด้วย ผู้แทน 4 สถาบันการศึกษา จะเป็นผู้เปิดบัตรลงคะแนนรอบตัดสินเพื่อสรุปผลงานที่ได้รับรางวัลทั้งหมด โดยผลการลงคะแนนจะถูกเก็บรักษาเป็นความลับสูงสุด เพื่อประกาศในวันประกาศผลต่อไป