ยืม log in เพื่อนมาใช้ค่ะ (ไม่เคยเล่น พันทิปมาก่อน ได้แต่อ่าน)
เพิ่งเริ่มใช้ blast NCBI แต่ไม่รู้ทำถูกไหม
คืออยากรู้ว่า sequence ที่ตัวเองใช้ มัน cross กับ แบคทีเรียตัวอื่นไหมหน่ะค่ะ
หลังจากใส่ sequence แล้ว
มีช่องใส่ organism
สงสัยว่า ช่องนี้ จำเป็นต้องใส่ไหม ... คือ ลองใส่แล้ว มันก็ขึ้นแต่ตัว organism ที่เราใส่ เราก็ไม่รู้เลยว่า มัน cross กับ แบคทีเรียอื่นๆ หรือเปล่า
ลองไม่ใส่ ช่อง organism มันก็จะขึ้นมาหลากหลายแบคทีเรียก แต่ ตัวบนๆ ก็เป็น แบคทีเรียที่เราต้องการนะคะ
ส่วน ผลด้านขวามือ max score, total score, query cover, E value, Ident มันคืออะไรหรือคะ ลอง search ดูหลายๆอัน อ่านแล้วก็ไม่เข้าใจ
สรุปที่อยากถามคือ
1 ถ้าจะหาว่า มัน cross กับ แบคทีเรียอื่นๆไหม ต้องใส่ ชื่อ bacteria ที่ช้อง organismไหม
2 ถ้ามันออกมาแล้ว จะดูไงว่า มัน จำเพาะ กับ แบคทีเรียของเราไหม รึเปล่า คือ ไม่รู้ว่า พวก max score, total score, query cover, Evalue Ident มันดูยังไง เอาเลขเท่าไหร่เป็นจุดตัด บลาๆๆๆ
ขอบคุณค่ะ
เกี่ยวกับการ blast primer ที่ทำ Real time PCR ค่ะ
เพิ่งเริ่มใช้ blast NCBI แต่ไม่รู้ทำถูกไหม
คืออยากรู้ว่า sequence ที่ตัวเองใช้ มัน cross กับ แบคทีเรียตัวอื่นไหมหน่ะค่ะ
หลังจากใส่ sequence แล้ว
มีช่องใส่ organism
สงสัยว่า ช่องนี้ จำเป็นต้องใส่ไหม ... คือ ลองใส่แล้ว มันก็ขึ้นแต่ตัว organism ที่เราใส่ เราก็ไม่รู้เลยว่า มัน cross กับ แบคทีเรียอื่นๆ หรือเปล่า
ลองไม่ใส่ ช่อง organism มันก็จะขึ้นมาหลากหลายแบคทีเรียก แต่ ตัวบนๆ ก็เป็น แบคทีเรียที่เราต้องการนะคะ
ส่วน ผลด้านขวามือ max score, total score, query cover, E value, Ident มันคืออะไรหรือคะ ลอง search ดูหลายๆอัน อ่านแล้วก็ไม่เข้าใจ
สรุปที่อยากถามคือ
1 ถ้าจะหาว่า มัน cross กับ แบคทีเรียอื่นๆไหม ต้องใส่ ชื่อ bacteria ที่ช้อง organismไหม
2 ถ้ามันออกมาแล้ว จะดูไงว่า มัน จำเพาะ กับ แบคทีเรียของเราไหม รึเปล่า คือ ไม่รู้ว่า พวก max score, total score, query cover, Evalue Ident มันดูยังไง เอาเลขเท่าไหร่เป็นจุดตัด บลาๆๆๆ
ขอบคุณค่ะ