X-Men: Apocalypse เปิดเรื่องด้วยบทบรรยายถึงการสำคัญตนผิดของมนุษย์ (รวมถึงมนุษย์กลายพันธ์) เมื่อมีพลังอำนาจหรือความสามารถพิเศษ

เช่นเดียวกับ Apocalypse ที่หลงในพลังอำนาจอันยิ่งใหญ่ของตน จนตั้งตนเป็นพระเจ้าปกครองโลกมนุษย์

เมื่อ Apocalypse ตื่นขึ้นมาในยุค 80s หลังจากถูกฝังทั้งเป็นโดยมนุษย์ผู้ต่อต้านเขาในยุคอียิปต์โบราณ เขาพยายามที่จะทวงคืนตำแหน่งพระเจ้าของโลกใบนี้อีกครั้ง



ทางด้านของ Erik (Magneto) ที่หนีไปใช้ชีวิตแบบหลบซ่อนใน Poland ได้กลายเป็นพ่ออีกครั้ง ขณะที่ Charles ก็กำลังไปได้สวยกับโรงเรียนสำหรับผู้มีความสามารถพิเศษ ที่เริ่มมีลูกศิษย์มากมาย



ดังนั้นประเด็นหลักของ X-Men: Apocalypse จึงวนเวียนอยู่กับชาย 3 คนกับอำนาจในฐานะผู้ปกครองของพวกเขา