ลองดูครับผมทำ minimum กับ maximum ละ ส่วน average ลองหัดทำดูนะครับ อธิบายให้คร่าวๆคือ
คุณไป get ค่าใน array ที่ไม่ใช่ -1 ออกมาว่ามีกี่ตัวแล้วเก็บค่าไว้ (ลองดูจากที่ผมทำใน maximum กับ minimum) แล้ว
นำค่าที่ไม่ใช่ -1 บวกกับให้หมด แล้วหารด้วยจำนวนที่เก็บไว้เมือ่กี้จะได้ average มาลองๆหัดทำดูครับ

ปล.ทำไมโปรแกรมเปิดมาแล้วมันจอขาวหว่าต้องขยายแล้วย่อถึงขึ้น
ปล2.ตัวแปรที่เก็บค่า score ไม่ควรเป็น String นะครับ
ปล3.ไปดักเออเร่อเองนะ กรณี score ใส่เป็น String มันจะเกิด exception
ปล4.อันนี้ผมเขียน code แบบของผมนะ อาจจะลักไก่หรือเขียนไม่ค่อยสวยขออภัยด้วยผมก็เป็น นศ.เรียนอยู่เหมือนกัน

งงตรงไหนโพสไว้เด่วมาตอบให้คับ ผมก็แกะ code คุณอยู่ซักพักเหมือนกัน
[Spoil] คลิกเพื่อดูข้อความที่ซ่อนไว้import java.awt.Container;
import java.awt.event.ActionEvent;
import java.awt.event.ActionListener;
import java.util.Arrays;
import java.util.Collections;

import javax.swing.JButton;
import javax.swing.JFrame;
import javax.swing.JLabel;
import javax.swing.JOptionPane;
import javax.swing.JTextArea;
import javax.swing.JTextField;

public class student extends JFrame implements ActionListener {
    private static int currentDataIndex = 0;
    private String code[] = new String[40];
    private String names[] = new String[40];
    private int scores[] = new int[40];

    /****************/
    private static final long serialVersionUID = 1L;
    private JLabel student, name, score;
    private JTextField scode, sname, sscore;
    private JFrame window;
    private JButton Btn1, Btn2, Btn3;
    private JButton minscore, maxscore, averagescore;
    private JTextArea areas;
    private int count = 0;
    /****/
    private JLabel Mins, Maxs, Avers;
    private JTextField Mintf, Maxtf, Avertf;

    /***/
    public student() {
        Arrays.fill(scores, -1);
        window = new JFrame("Programm Student | KMUTNB PRACHINBURI CAMPUS");
        window.setSize(480, 573);
        window.setVisible(true);
        window.setBounds(200, 200, 474, 573);
        window.setDefaultCloseOperation(JFrame.EXIT_ON_CLOSE);
        buildpanel();
    }

    private void buildpanel() {
        // จัดรูปแบบ layout แบบ Absolute
        Container c = window.getContentPane();
        c.setLayout(null);
        student = new JLabel("Enter Student code  : ");
        student.setBounds(40, 10, 500, 30);
        scode = new JTextField();
        scode.setBounds(170, 13, 140, 26);
        /****/
        name = new JLabel("Enter Student name : ");
        name.setBounds(40, 40, 500, 30);
        sname = new JTextField();
        sname.setBounds(170, 45, 250, 26);
        /****/
        score = new JLabel("Enter Student score : ");
        score.setBounds(40, 70, 500, 30);
        sscore = new JTextField();
        sscore.setBounds(170, 75, 140, 26);
        /****/
        Btn1 = new JButton("Add data");
        Btn1.setBounds(60, 106, 100, 30);
        Btn1.addActionListener(this);
        Btn2 = new JButton("Clear data");
        Btn2.setBounds(180, 106, 100, 30);
        Btn2.addActionListener(this);
        Btn3 = new JButton("Show Record");
        Btn3.setBounds(300, 106, 120, 30);
        Btn3.addActionListener(this);
        /****/
        areas = new JTextArea();
        areas.setBounds(10, 146, 440, 210);
        areas.setEditable(false); // setไม่ให้พิมพ์ข้อความได้
        /****/
        minscore = new JButton("Minimum Score");
        minscore.setBounds(10, 365, 140, 30);
        minscore.addActionListener(this);

        maxscore = new JButton("Maximum Score");
        maxscore.setBounds(160, 365, 150, 30);
        maxscore.addActionListener(this);
        averagescore = new JButton("Average Score");
        averagescore.setBounds(320, 365, 130, 30);
        averagescore.addActionListener(this);
        /****/
        Mins = new JLabel("Minimum Score  : ");
        Mins.setBounds(40, 400, 120, 30);
        Mintf = new JTextField();
        Mintf.setBounds(150, 400, 270, 30);
        /***/
        Maxs = new JLabel("Maximum Score  : ");
        Maxs.setBounds(40, 434, 120, 30);
        Maxtf = new JTextField();
        Maxtf.setBounds(150, 435, 270, 30);
        /***/
        Avers = new JLabel("Average Score  : ");
        Avers.setBounds(40, 470, 120, 30);
        Avertf = new JTextField();
        Avertf.setBounds(150, 470, 170, 30);
        // เพิ่มลง container
        c.add(student);
        c.add(scode);
        c.add(name);
        c.add(sname);
        c.add(score);
        c.add(sscore);
        c.add(Btn1);
        c.add(Btn2);
        c.add(Btn3);
        c.add(areas);
        c.add(minscore);
        c.add(maxscore);
        c.add(averagescore);
        c.add(Mins);
        c.add(Mintf);
        c.add(Maxs);
        c.add(Maxtf);
        c.add(Avers);
        c.add(Avertf);
        /****/
    }

    public void addData() {
        String output = "";
        code[currentDataIndex] = scode.getText();
        names[currentDataIndex] = sname.getText();
        scores[currentDataIndex] = Integer.parseInt(sscore.getText());
        output = output + code[currentDataIndex] + "                " + names[currentDataIndex] + "                "
                + scores[currentDataIndex] + "\n";
        areas.append(output);
        ++currentDataIndex;

    }

    public void clearData() {
        areas.setText("");
        currentDataIndex = 0;
        code[count] = "";
        names[count] = "";
        scores[count] = -1;
    }

    public void minimum() {

        int[] arrayTemp = scores;
        for (int i = 0; i < arrayTemp.length; i++) {
            if (scores != -1) {
                arrayTemp = scores;
            }
        }
        Arrays.sort(arrayTemp);
        for (int i = 0; i < arrayTemp.length; i++) {
            if (arrayTemp != -1) {
                Mintf.setText(arrayTemp + "");
                break;
            }
        }
        // System.out.println(Arrays.toString(arrayTemp));
        // Mintf.setText(arrayTemp[0] + "");
    }

    public void maximum() {
        /*
         * int a = 0; int s = Integer.parseInt(scores[0]); for(int
         * i=0;i<count;i++) { if(Integer.parseInt(scores)> s) { a =
         * Integer.parseInt(scores); } } String strIs = Integer.toString(a);
         * Maxtf.setText(strIs);
         */
        Integer[] arrayTemp = new Integer[scores.length];
        for (int i = 0; i < arrayTemp.length; i++) {
            arrayTemp = Integer.valueOf(scores);
        }
        for (int i = 0; i < arrayTemp.length; i++) {
            if (scores != -1) {
                arrayTemp = scores;
            }
        }
        // Arrays.sort(arrayTemp);
        Arrays.sort(arrayTemp, Collections.reverseOrder());
        Maxtf.setText(arrayTemp[0] + "");

    }

    public static void main(String[] args) {
        new student();

    }

    public void actionPerformed(ActionEvent event) {
        if (event.getSource() == Btn1) {
            addData();
        } else if (event.getSource() == Btn2) {
            clearData();
        } else if (event.getSource() == Btn3) {
            JOptionPane.showMessageDialog(null, "Student Record : " + count, "Message",
                    JOptionPane.INFORMATION_MESSAGE);
        } else if (event.getSource() == minscore) {
            minimum();
        } else if (event.getSource() == maxscore) {
            maximum();
        } else if (event.getSource() == averagescore) {

        }
    }

}