ทั้งนักดำน้ำแบบผิวน้ำและนักดำน้ำแบบ Scuba ล้วนเป็นตัวทำลายแนวปะการังอีกตัวการหนึ่ง  การทำลายเกิดจากการรู้เท่าไม่ถึงการณ์เช่นการลอยตัวไม่ดี บางครั้งจมจงไปทับหรือไปเหยียบกอปะการังสวยๆ จนหักเสียหายและตายไป บางคนเข้าใกล้ปะการังจนเกินไปพอโดยคลื่นใต้น้ำพัดก็ลอยไปกระแทกปะการังเสียหาย นักดำน้ำควรฝึกทักษะการลอยตัวให้ดีก่อนที่จะดำเข้าใกล้แนวปะการัง ถ้าไม่แน่ใจในฝีมือตัวเองก็ให้ดำอยู่ห่างๆ เพื่อความปลอดภัยกับแนวปะการัง และปลอดภัยกับตัวท่านเองเพื่อจะได้ไม่ไปสัมผัสกับปะการังมีพิษจำพวกปะการังไฟหรือพวกไฮดรอยส์  ส่วนนักดำน้ำแบบผิวน้ำมักจะสร้างความเสียหายด้วยการยืนบนแนวปะการัง