สงครามนั้นไม่มีอยู่จริง หุ่นชนะมนุษย์มานานแล้ว ชนะแบบราบคาบในระดับที่เพาะเลั้ยงเล่นได้ ส่วนใหญ่เพาะไว้ทำพลังงานชีวภาพ เหมือนขี้หมู
อาณาจักรวัฒนธรรมมนุษย์ในไซออน ไม่มีอยุ่จริง บ้านเมือง เทคโนโลยีต่างๆ นั้นหุ่นเป็นผู้สร้างขึ้นมา แล้วปล่อยมนุษย์เข้าไปออกลูกออกเต้าในนั้น
ผู้ปลดปล่อยนั้นไม่มีอยู่จริง นีโอเป็นแค่หนูแคนดิเดตรุ่นหกที่โดนฉีดอะดรีนาลีนทำให้กัดกรงพลาสติกขาดได้(เปรียบเทียบ)
ที่ทำเช่นนี้เพื่อกำหนดให้เป็นตัวแทนมนุษย์ และตัดสินใจแทนมนุษย์ทั้งหมด
มอเฟียส เป็นเครื่องมือที่ถูกหลอกใช้ตั้งแต่ต้นยันปลาย ให้เป็นตัวแทนข่าวลือ
หรือนิยาย ว่าผู้กู้โลกนั้นมีจริง เพื่อบีบให้หนูแคนดิเดตนีโอยอมรับสภานภาพว่าเป็นตัวแทนมนุษย์ ด้วยการเชิดชูของมนุษย์ด้วยกัน
ไตรนิตี้ เป็นหนูอีกตัวหนึ่งที่ใส่เพิ่มในการทดลองเพิ่อสร้างความหลากหลายของการตัดสินใจ
เนื่องจากห้ารอบที่ผ่านมาตอบข้อ b เหมือนกันหมดทุกคน เลยใส่ปัจจัยความรักเข้ามาด้วย
ออราเคิล เป็นโปรแกรมเก็บสถิติ ทำท่าเหมือนรู้ทุกอย่างแต่จริงๆไม่รู้อะไรเลย (เวลาพูดเลยมีแต่abstract)
มีหน้าที่ยุให้คนคิดและเลือกอย่างเป็นธรรมชาติที่สุด เพื่อให้การทดลองได้ผลที่สมจริง
อาร์คิเทก เป็นโปรแกรมสร้างโลกเสมือน โดยอาศัยสถิติของออราเคิล มาพัฒนาให้เกิดรูปแบบใหม่ๆ
สมิทธ เป็นโปรแกรมตรวจจับความผิดปกติของโปรแกรมย่อยๆในเมทริกซ์ มีความสามารถในการคิดนอกเหนือคำสั่ง ซึ่งเป็นฟีเจอร์ที่ยังควบคุมไม่ได้
ในทางหุ่นแล้วถือว่าไม่ใช่บัก แต่เป็นความไม่สมบูรณ์แบบ เท่านั้น
เมโรวินเจียน และพ่อของซาตี้ก็มีฟีเจอร์ชนิดเดียวกัน
เดอุส มาชินา คือโคตรหุ่น หรือกษัตริย์แห่งหุ่นทั้งหมด สามารถควบคุมเครื่องจักรทั้งหมดรวมถึงโปรแกรมทั้งหมดด้วย
ตอนสุดท้ายที่สมิทธชนะนีโอแล้วอยู่ๆโดนธาตุไฟเข้าแทรกตายก็เพราะโดนคำสั่งตรงจากท่านมาชินา
เมฆหมอก emp เป็นแค่ผลลัพธ์ของสงครามในยุคที่มนุษย์ยังไม่แพ้ อุปกรณ์อิเลกโทรนิกส์ทั้งหมดที่เข้าใกล้จะหยุดทำงาน
นีโอมองเห็นพลังงานเป็นสีทองหลังจากตาบอด และหยุดเครื่องจักรได้ด้วยมือเปล่า
คำอธิบายจากผู้กำกับคือ telepathy หรือพลังจิต มองว่าเป็นพลังงานชนิดหนึ่งและควบคุมได้
เมโรวินเจียน เป็นโปรแกรมเก่าที่มีหน้าที่คัดแยกโปรแกรมว่าจะเก็บไว้หรือลบทิ้งไป
แต่ด้วยที่ว่ามีฟีเจอร์คิดเองได้ เลยกร่างทำตัวเป็นอบต.ไม่ขึ้นตรงต่อใครและเก็บโปรแกรมที่ไม่ควรเก็บไว้
เช่นเดอะทวิน ที่มีสิทธิ เข้าถึงแบบ readonly ได้ทุกแห่งหน หรือคีย์เมกเกอร์ ที่ใช้กู้ password
สุดท้ายเมทริกซ์คือโปรแกรมโลกเสมือน ที่ถูกสร้างโดยโปรแกรมอาร์คิเทค ใช้ในการสร้างภาพ
ให้กับมนุษย์หลอดแก้ว ไม่ได้ทำมาเพื่อควบคุมมนุษย์ แต่ทำมาเพื่อให้เกิดข้อเปรัยบเทียบ ระหว่างโลกจริง กับโลกเสมือน
เมิ่อเกิดการเปรัยบเทียบ ก็เกิดการเลือก ตามโจทย์ของการทดลอง
โดยการเลือกนั้นมีตั้งแต่เลือกที่จะลำบากอยู่กับความจริง หรือเลือกที่จะสบายในโลกปลอม